Het klassieke piratenverhaal van Robert Louis Stevenson gaat een eigen leven leiden in handen van de hilarische Muppets! Muppet Treasure Island is de super grappige, uiterst muzikale en deinende avonturenfilm waar het hele gezin steeds weer van zal genieten. Het begint allemaal als de jonge Jim Hawkins een verloren gewaande kaart erft waarop staat waar de beroemde piratenschat van Kapitein Flint ligt. Jim huurt het grote schip de Hispaniola, waarop hij kennis maakt met de goede kapitein Smollett (Kermit de Kikker) en de slechte, maar charmante Long John Silver (Tim Curry). Ze varen de grote, open zee op met hun hoofd vol avontuur en gouden piratenschatkisten voor ogen. Maar achter iedere golf gaat groot gevaar schuil - waaronder Benjamina Gunn (Miss Piggy), de op Schateiland aanbeden Godin van de Liefde, die er een stuk minder gevaarlijk uitziet dan ze is!

In het Victoriaanse Engeland moeten een parochieraadslid en een crimineel gaan schuilen voor een storm. Ze vinden onderdak in een afgelegen herberg op het platteland. Al snel ontdekken ze een dodelijk pact tussen de gestoorde herbergiers en de bloeddorstige weerwolven die de omringende bossen bevolken.