The Lighthouse speelt zich af in New England van 1890. Twee vuurtorenwachters zitten voor lange tijd vast op het door mist omgeven eiland. Wanneer er een storm losbarst proberen ze de tijd te doden door veel alcohol te drinken, dat wakkert allerlei demonen bij hun aan, langzaam beginnen zij elkaar steeds meer te verachten.

Op een onbewoond eiland 20 mijl van de ruige Schotse kust, arriveren drie vuurtorenwachters voor hun zesweekse dienst. Terwijl James, Thomas en Donald hun normale stille routine vastleggen, gebeurt er iets onverwachts, mogelijk levensveranderend - ze struikelen over goud.